من طرف راستوب :
RASTOP
هذا البرنامج يعتبر أحد البرامج التي تهتم بدراسة
وفهم البنية الفراغية للبروتينات ووظيفتها حيث يعرض برنامج Rastop على الشاشة
الجزيئات في أبعادها الثلاثة مع امكانية التحكم بالشكل والحجم و يشمل مجموعة من
التعليمات و الأوامر مكتوبة فوق النافذة الرئيسية في صورة أيقونات.
يستعمل هذا البرنامج (حسب المناهج الجديدة ) في المستوى
الثانوي لشرح البنية الفراغية للبروتينات و فهم العلاقة بين بنية البروتين ووظيفته
على مستوى العضوية .
ونحتاجه لـ :
1) عرض البنية الفراغية للجزيئات على الشاشة (بروتينات ،
أحماض نووية ......) وتحديد وضعيتها في الفراغ .
2) تغيير عرض الجزيئة باستعمال أزرار العرض من النافذة
الرئيسية .
3) عرض عدة جزيئات على نفس النافذة .
4 )التعرف على تركيب وخصائص البروتينات .
5)يعرض جميع ملفات البروتينات ذات
الامتداد PDB .
لاستعمال برنامج Rastop
نحتاج إلى مايلي
(1) تحميل البرنامج
(2):تحميل ملفات البروتينات .
توجد الملفات الأصلية للبروتينات في بنك خاص يسمى بنك البروتينات
Protine Data Bank PDB،
وكل بروتين له رمز واحد خاص به فمعرفته تسهل الحصول على ملفات
البروتينات ، ونظرا لكثرة عدد البروتينات التي توجد في بنك
PDB
أكثر من4363
اعتمدنا على بعض ملفات البروتينات الموجودة في الموقع التالي
http://www.ens-kouba.dz/arabic/tlech%
ملاحظة
: يستحسن وضع ملفات البروتينات التي تم
تحميلها في نفس المجلد الذي تم فيه وضع برنامج راستوب .
أما إذا أردت الحصول على ملفات أخرى من البروتينات اتصل بالموقع
التالي :
http://www.rcsb.org/pdb
(3): تعلم طريقة الاستعمال : تكون بمساعدة الأستاذ .
أ ـ حمل
برنامج راستوب
اضغط هنا
ب ـ تحميل ملفات البروتينات في الجدول الموالي
| تسمية البروتين | وصفه | رمزه | التحميل |
| lysozyme | إنزيم مرتبط بالركيزة | 1HEW | حمل |
| lysozyme | إنزيم الليزوزيم مرتبط بـNAG6 | 1LZS | حمل |
| carboxy peptidase | إنزيم كربوكسيبتيداز | 3CPA | حمل |
| insuline | هرمون الأنسولين (الإنسان) | 2hiu | حمل |
| myoglobine | بروتين عضلي | 1A6G | حمل |
| oxyhymoglobine | بروتين دموي | 2DN1 | حمل |
| carbomonoxyhymoglobine | 2DN3 | حمل | |
| dhoxyhymoglobine | 2DN2 | حمل | |
| immunoglobuline | بروتين مناعي | IGGTOTAL | حمل |
| fab fragment-glucose | IGG - LYS | حمل | |
| facilitative glucose | بروتينات ناقلة | 1SUK | حمل |
| pompe de calcium | 1WPE | حمل | |
| (photo systeme I (PSI | الأنظمة الضوئية | 1JBO | حمل |
| (photo systeme II(PS | 2AXT | حمل | |
| ATP synthetase FO | ATP Synthas | 1C17 | حمل |
| ATP synthetase F1 | 1E79 | حمل | |
| potassium channel protein | قناة البوتاسيوم | 18L8 | حمل |
| Nicotinic acetylcholine receptor | مستقبل الاسيتيل كولين | 2BG9 | حمل |
عدل سابقا من قبل زيري بن مناد في السبت 28 أغسطس 2010 - 3:21 عدل 1 مرات
